怀孕期间请病假，公司是否扣工资需结合法律和实际情况判断。通常，公司不能随意扣工资，应依规支付病假工资。若有医疗机构出具的真实有效病假证明，且符合公司病假申请流程，公司应按不低于当地最低工资标准80%（具体依当地规定及公司合法制度）支付，不得全额扣除。若未提供有效病假证明或未按流程申请，公司可能按旷工或事假处理，扣工资需符合合同及制度约定，且扣除后不低于最低工资。若公司制度中病假工资规定低于法定最低标准，即便经民主程序制定公示，该条款也因违法无效，公司仍需按法定最低标准支付。
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怀孕期间请病假扣工资，特殊情况或例外情形会影响处理结果，具体分析如下：
1、公司合法有效的特殊制度。若公司关于病假工资的支付标准和方式，经民主程序制定并公示，且不低于当地最低工资80%的法定标准（如制度规定按员工工资70%支付且该标准高于法定），则该制度对女职工有约束力。
2、女职工病假期间违规。若病假期间存在严重违规（如提供虚假病假证明），公司可依制度处罚并扣减工资，但扣减应基于违规行为而非单纯病假。
3、双方劳动合同另有合法约定。若劳动合同明确约定且不低于法定标准（如约定85%支付），则优先按合同执行。
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怀孕期间请病假扣工资，公司可能面临法律风险，具体如下并举例：
1、支付赔偿金风险。依据《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条，公司未按约定或国家规定足额支付劳动报酬（如病假工资低于当地最低工资80%），经劳动行政部门责令限期支付仍未支付的，除补发差额外，还需按应付金额50%-100%支付赔偿金。
2、女职工维权困难风险。若女职工无法提供有效病假证明、工资记录等证据，劳动仲裁或诉讼时可能因举证不能而败诉。
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怀孕期间请病假，需避免以下错误操作以维护权益：
1、未及时办理病假手续。如未按时提交证明或提前申请，公司可能以“未履行程序”按旷工扣工资，即使事后补证也可能被认定为旷工。
2、忽视保存证据。如未保留病假条、工资条等，争议时难以举证。
3、轻信公司口头承诺。如公司口头承诺照发工资但实际扣除，因无书面凭证难以维权。若已出现上述情况，建议尽快补正手续、收集证据。为全面评估风险并制定策略，可进一步咨询我为您解答。

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